Thesis supervisor: Gergely Keszler
Location of studies (in Hungarian): SE Molekuláris Biolgiai és Patobiokémiai Intézet Abbreviation of location of studies: SE
Description of the research topic:
Vizsgálatunk elsődleges célja egyes környezeti-meteorológiai faktorok (külső hőmérséklet, csapadék, légnyomás, szélerősség) és a hirtelen szívhalál közötti kapcsolat genetikai és epigenetikai hátterének bizonyítása, illetve feltárása.
Epidemiológiai adatok egyértelműen azt mutatják, hogy az ischémiás illetve arritmiás eredetű hirtelen szívhalál kockázata a téli hónapokban jelentősen magasabb a meleg nyári hónapokhoz viszonyítva. A jelenség hátterében a szimpatikus idegrendszer aktivációját, illetve a szívizom mitogén jelpályák következtében fellépő átépülését feltételezik, de a pontos patobiokémiai háttér távolról sem tisztázott. A környezeti tényezők hosszú távú eltéréseket okozhatnak a szövetek génexpressziós profiljában, ami irodalmi adatok alapján részben a DNS-metilációs mintázatban bekövetkezett változásoknak tulajdonítható.
A molekuláris mechanizmus tisztázása érdekében teljes genom DNS-metilációs vizsgálatot tervezünk elhunyt személyekből származó szívizomszövet-mintákon. Ezzel egyidejűleg microarray alapú globális génexpressziós vizsgálatot végzünk ugyanazokból a szövetmintákból, majd kapcsolatot keresünk az egyes gének expressziója, illetve promoterük metiláltsága, valamint a környezeti faktorok között. Az így kapott adatokat útvonal-analízis segítségével vizsgálva igyekszünk feltárni a környezeti tényezők által befolyásolt jelpályákat és az azokban érintett legfontosabb kandidáns géneket. Az azonosított kandidáns gének epigenetikai és transzkripciós szintű szabályzását a későbbiekben részletes funkcionális vizsgálatokkal próbáljuk feltérképezni.
A vizsgálathoz 3x5 elhunyt személyből származó szívizom-mintára lenne szükségünk, akik (1) hirtelen szívhalál következtében a téli hónapokban, (2) hirtelen szívhalál következtében a nyári hónapokban, illetve (3) nem kardiovaszkuláris betegségben hunytak el. A mintavételhez szükséges etikai engedély rendelkezésünkre áll. A szövetmintákat a Semmelweis Egyetem Igazságügyi Orvostani Intézetében kerülnek kivételre, a molekuláris vizsgálatokra az Orvosi Vegytani Intézetben kerül sor.
Number of students who can be accepted: 3
Deadline for application: 2024-06-30
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
