Thesis supervisor: András Guttman
Location of studies (in Hungarian): Pannon Egyetem, Mérnöki Kar, Bio-nanotechnológiai és Műszaki Kémiai Kutatóintézet Abbreviation of location of studies: MÜKKI
Description of the research topic:
Az elmúlt évtizedekben egyre nagyobb fény derült a fehérjékhez kötött N-glikánok jelentőségére és ezen komplex szénhidrát struktúrák immunválaszokban betöltött fontos szerepére (sejt-sejt és sejt-mátrix közti interakciók). A glikánok vizsgálata mára már olyan komoly gazdasági területekre gyakorol jelentős hatást, mint a fehérje alapú gyógyszergyártás (monoklonális antitestek, bioszimilárisok), illetve az egészségügy – pl. biomarker kutatás – a korai diagnosztizáláson keresztül. A glikánok élettani jelentőségét jól reprezentálja, hogy a transzlációs folyamatok során több, mint 650 enzim vesz részt a glikoproteinek végleges szerkezetének kialakításában. A glikánok minőségi és mennyiségi meghatározása komoly kihívásokat tartogat – a bonyolult szerkezetük, biokémiai viselkedésük, kis koncentrációjuk és a biológiai mátrix komplexitása miatt –, így vizsgálatuk több lépcsős, összetett mintaelőkészítési és elválasztási módszerek kidolgozását igényli. A Ph.D. hallgató feladata gyors és robusztus mintaelőkészítési módszerek kidolgozása és vizsgálata, első sorban gyógyszeripari glikoproteinek analízisére kapilláris elektroforézissel. Az optimálandó mintaelőkészítési lépések magukba foglalják a glikánok célzott enzimatikus lehasítását a fehérjékről, azok fluorofór ágenssel való megjelölését, valamint a felesleges jelölőanyagtól való tisztítását. Mindezeken túl, a hallgató feladata az előkészített glikán struktúrák azonosítása további specifikus enzimekkel (exoglikozidáz) történő szekvenálással, valamint tömegspektrometriás csatolás segítségével.
Required language skills: angol Further requirements: A kutatási téma szorosan kapcsolódik a Transzlációs Glikomika Kutatócsoport tevékenységéhez, ahol szerteágazó kutatómunka folyik a bioanalitikai eljárások és eszközök kifejlesztéséhez kapcsolódóan.
Number of students who can be accepted: 1
Deadline for application: 2023-06-30
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).