Thesis supervisor: Norbert Gyöngyösi
Location of studies (in Hungarian): Semmelweis Egyetem EOK Abbreviation of location of studies: SE
Description of the research topic:
A téma célkitűzései
Célunk a sejtciklus és cirkadián óra közötti interakció vizsgálata. Eredményeink arra utalnak, hogy a cirkadián óra éhezésre adott válaszában szerepet játszik a protein foszfatáz 2A B55-ös (PP2AB55) regulátor alegysége. Ismert, hogy a PP2AB55 gátlása elősegíti a mitózist szabályozó, egy ciklin dependens kinázból (Cdk1) és ciklin B-ből álló M-fázis promoting faktor aktivitását. Ismert továbbá, hogy az endoszulfinok (ENDOS) foszforilációja a GREATWALL (GWL) kináz által gátolja PP2A aktivitását, és így serkenti az osztódást, a GWL aktivitását pedig a TOR complex-1 szabályozza.
Hipotézisünk szerint a sejtciklus és cirkadián óra interakciójának egy fontos szabályozási pontja a PP2A, mely szinkronizálni képes a két ciklus tápanyagkínálatra adott válaszát, az TORC1-GWL-ENDOS-PP2AB55 útvonalon.
Célunk a PP2AB55 interaktómjának és szerepének vizsgálata a cirkadián óra és a sejtciklus szabályozásában különböző tápanyagkínálatok mellett. Kutatásunkban komplex rendszerbiológiai megközelítést alkalmazunk: ötvözzük a proteomikai és klasszikus molekuláris biológiai megközelítést, adatainkat pedig matematikai modellbe építjük be. A PP2AB55 interaktómot BioID megközelítéssel tervezzük feltérképezni. Kísérleteink során a cirkadián biológia egy kedvelt modellorganizmusát, a Neurospora crassa fonalas gombát használjuk, a kapott adatokat pedig validáljuk emlős sejtvonalakon. Vizsgálataink ilyentén felépítése gazdaságosabbá és gyorsabbá teszi a kísérletes munkát.
Munkánk során a következő kérdéseket vizsgáljuk:
-A PP2A útvonal vizsgálata proteomikai analízissel
-A cirkadián óra metabolikus változásokra adott válaszában szerepet játszik-e a TORC-GREATWALL(GWL)-ENDOSULFIN(ENDO)-PP2A útvonal.
-A cirkadián óra metabolikus változásokra adott válaszában szerepet játszanak-e a sejtciklus szabályozó fehérjéi
-Annak kimutatása, hogy a sejtciklus metabolikus változásokra adott válaszában szerepet játszik-e a cirkadián óra.
Várható eredmények és jelentőségük:
Célunk, hogy a PP2A lehetséges szerepének feltárásával a sejtciklus és cirkadián ritmus közötti kapcsolatokat jobban felderítsük, és ez potenciális jelentőséggel bír a tumoros betegségek és más, kapcsolódó rendellenességek megértésében. Emellett az, hogy mind Neurosporában, mind emlős sejteken elvégezzük vizsgálatainkat, segít eredményeinket evolúciós kontextusba helyezni, és a szabályozás konzerválságát vizsgálni. A proteomikai, molekuláris biológiai és matematikai eszközök kombinációja pedig új, rendszerbiológiai eredményekkel szolgálhat.
Deadline for application: 2021-09-17
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
