Thesis supervisor: Dániel Veres
Location of studies (in Hungarian): Semmelweis Egyetem Abbreviation of location of studies: SE
Description of the research topic:
Napjainkra a humán jelátviteli utak hálózatos leírása több mint kétezer fehérje és mikroRNS sokezer kapcsolatát összefoglaló rendszerré vált. A jelátviteli hálózatok szinte valamennyi leírása azonban nem, vagy nem kellőképpen veszi figyelembe az adott fehérjék, illetve mikroRNS-ek sejten belüli lokalizációját, illetve e lokalizációnak adott jelre, illetve a malignus transzformáció során való megváltozását, azaz a fehérje (avagy mikroRNS) transzlokációját. Tervezett kutatási munkánk során a korábban a Nucleic Acid Research folyóiratban közölt két adatbázisunk, a ComPPI (Compartmentalized Protein-Protein Interaction network, http://comppi.linkgroup.hu/ 2015), illetve a Translocatome (http://translocatome.linkgroup.hu/ 2019) alapján a humán jelátviteli hálózatot jellemezni kívánjuk a hálózatot alkotó fehérjék, illetve mikroRNS-ek lokalizációja, illetve transzlokációja szerint. Különös figyelmet kívánunk annak szentelni, hogy a sejtek malignus transzformációja, illetve a metasztázis képzés során milyen lokalizáció-beli változások történnek, és ezek hogyan befolyásolják a jelátviteli hálózat szerkezetét és dinamikáját. Vizsgálatainkat az adott rákos sejt transzkriptómjára és mutációs profiljára specifikus, súlyozott élekkel rendelkező jelátviteli hálózatokkal is el kívánjuk végezni. Tervezzük proteomikai adatok beépítését is jelátviteli hálózatokba. Vizsgálataink új biomarkerekre és gyógyszer célpont jelöltekre hívhatják fel a figyelmet.
Deadline for application: 2022-10-10
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
