Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Zsolt Polgár
János Taller
A biotikus stressz-válasz genomikai vizsgálata a burgonyában

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Pannonia
plant breeding and botany
Festetics Doctoral School

Thesis supervisor: János Taller
co-supervisor: Zsolt Polgár
Location of studies (in Hungarian): Keszthely
Abbreviation of location of studies: KE


Description of the research topic:

A burgonya a sarkkörtől a trópusokig termeszthető kozmopolita növény. A különféle környezeti körülmények között a legkülönfélébb kórokozók károsíthatják. A kórokozók elleni védekezés legkézenfekvőbb módja rezisztenciagének introgresszálása a fajtába. Világviszonylatban a fitoftóra és a PVY vírus a burgonya legveszélyesebb kórokozói. A jelen kutatási programban a burgonyában végbemenő biotikus stressz-válasz folyamatokat tervezzük kutatni. Vizsgálataink középpontjában a PVY extrém rezisztencia áll. Növényanyagnak a számos rezisztenciagént tartalmazó, keszthelyi nemesítésű White Lady fajtát, valamint egy tüzetesebben még nem vizsgált, de PVY extrém rezisztencia forrásként számon tartott Solanum hougassii akcessziót tervezünk vizsgálni. Mindkét esetben teljes genomi szekvenálást végzünk, majd transzkriptomikai megközelítéssel vizsgáljuk a fertőzések hatására bekövetkező génexpressziós változásokat. Elsődleges célunk a rezisztenciában meghatározó szerepet játszó gének izolálása. Célunk továbbá a rezisztencia-választ szabályozó mechanizmusok feltárása, melyhez a rezisztenciagének környezetében található, a génkifejeződést szabályozó mikro- és kis RNS-eket tervezzük azonosítani és vizsgálni. A rezisztencia gén-jelöltek valódi funkcióját genomszerkesztési technikákkal (CRISPR/Cas9) inaktivált, illetve módosított génjelölteken keresztül tervezzük vizsgálni.
Ez az alapkutatásnak minősülő megközelítés reményeink szerint a burgonya rezisztencianemesítésben közvetlenül hasznosítható új ismereteket eredményez.
Transzkriptomikai megközelítéssel szekvencia-szintű és expressziós ismereteket szereztünk a White Lady fajtában előforduló biotikus stressz-válasz génekről és homológokról. Elvégeztük a rezisztenciaválaszban jelentősnek gondolt gének expressziójának vizsgálatát qPCR-rel a fertőzés pillanatától a fertőzés utáni 65. óráig bezárólag hét időponttal reprezentálva. Létrehoztunk egy Agrobaktérium által közvetített tranziens expressziós rendszert, és azonosítottunk egy ez idáig nem ismert gént, melynek központi szerepe lehet a fitoftóra rezisztenciában. Molekuláris genetikai megközelítésű burgonya rezisztenciakutatási programunk mintegy két évtizedes múltra tekint vissza, számos tudományos publikáció és PhD dolgozat született ez idő alatt, valamint a nemesítés hatékonyságát segítő molekuláris eszközt fejlesztettünk ki.
A jelen program megvalósításához szükséges forrás a GINOP-2.3.2-15-2016-00054 pályázaton rendelkezésre áll.

Recommended language skills (in Hungarian): angol
Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2018-06-05


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )