Thesis supervisor: György Szittya
Location of studies (in Hungarian): NAIK-MBK, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. Abbreviation of location of studies: NAIK
Description of the research topic:
A növényi vírusok rendkívül változatos tüneteket és gyakran komoly gazdasági károkat okoznak, ezzel veszélyeztetve az élelmiszer ellátás biztonságát. Ennek ellenére mégis keveset tudunk a tüneteket okozó változások molekuláris mechanizmusairól. Kutatásunk fő célja, hogy először egy rendkívüli genetikai és genomikai eszköztárral rendelkező modellnövényben (Arabidopsis thaliana) tanulmányozzuk a tünetek kialakulásának molekuláris hátterét, és hogy azonosítsuk a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket. Kísérleteinkhez az Arabidopsis természetes földrajzi variánsait, ökotípusait használjuk, mert ezekben a genetikai különbségek az idők során a beltenyészetség miatt rögzültek. Ez különösen alkalmassá teszi őket az összehasonlító genetikai vizsgálatokra. A genetikai különbségek a vírustünetekben is megnyilvánulnak: eltérő ökotípusok eltérő erősségű tüneteket mutatnak egyazon vírussal való fertőzés után. Eddigi vizsgálataink során két olyan ökotípust találtunk, amelyek nagyon eltérően reagálnak a Tarlórépa Mozaik Vírussal (TuMV) és az Útifű Mozaik Vírussal (RMV) való fertőzés hatására. Hipotézisünk az, hogy az eltérő erősségű vírustüneteket mutató ökotípusokban a tünetek kifejeződésében szerepet játszó gének (mRNS, kis RNS) kifejeződésében is jelentős különbségek lesznek. Ezért a vírusokkal és üres kontrollal inokulált ökotípusokból RNS könyvtárakat fogunk készíteni genomszintű transzkriptom, kis RNSom és degradom szekvenáláshoz. Az mRNS és kisRNS expressziós profilokban megfigyelhető különbségek bioinformatikai elemzésével képesek leszünk azonosítani a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket. Emellett a genomikai módszerekkel kapott tünetmegjelenésért felelőssé tehető géneket genetikai térképezéssel is szeretnénk megerősíteni Rekombináns beltenyésztett vonalak segítségével (RIL).
Required language skills: angol Further requirements: 1 év molekuláris biológiai gyakorlat
Number of students who can be accepted: 1
Deadline for application: 2018-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
