Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Gábor Paragi
Computational modeling of the physical-chemical properties of small molecules

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Szeged
chemistry
Doctoral School of Chemistry

Thesis supervisor: Gábor Paragi
Location of studies (in Hungarian): SZTE OVI
Abbreviation of location of studies: OVI


Description of the research topic:

Elsősorban biológiailag érdekes molekulák fizikai, kémiai tulajdonságát, illetve más molekulákkal való kölcsönhatását vizsgáljuk elméleti kémiai módszerekkel. Ez részben a molekulákat lényegében klasszikusan kezelő molekulamechanikai, molekuladinamikai konformáció-analízist és a hasonló elvi alapokon nyugvó dokkolási eljárás alkalmazását jelenti konkrét rendszerekre. Másrészt, elsősorban a molekulák közötti kölcsönhatások esetében a pontosabb leírást kvantummechanikai módszerek (pl. sűrűségfunkcionál elmélet) felhasználásával adjuk meg.

1. Neurodegeneratív betegségek (pl Alzheimer-kór) számítógépes modellezése.
i. Oligomerek, peptidmimetikumok kölcsönhatásának vizsgálata amilod-β peptiddel.
ii. Aggregációs és gombolyodási folyamatok vizsgálata amiloid-β, illetve homo-polipeptidek esetében.
2. Peptidnukleinsavak konformációs vizsgálata.
3. Természetes és mesterséges nukleobázisok kölcsönhatásának vizsgálata sűrűségfunkcionál elmélettel. A szimmetria-adaptált molekulapálya módszer alkalmazása a hidrogén-híd leírására.

Number of students who can be accepted: 2

Deadline for application: 2018-05-31


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )