Thesis supervisor: György Pósfai
Location of studies (in Hungarian): MTA SZBK Biokémiai Intézet Abbreviation of location of studies: SzBK
Description of the research topic:
A genomok evolúcióját rövid, drámai expanziós ugrásokkal megszakított hosszú, dominánsan egyszerűsödéssel járó periódusok jellemzik. Ennek a folyamatnak a beható ismerete nélkülözhetetlen ahhoz, hogy mesterséges mikrobiális genomokat tudjunk tervezni. A genom evolúció tanulmányozásához a természetes ütem túl lassú, a felgyorsított laboratóriumi evolúcióhoz pedig hiányoznak a megfelelő eszközök. Egy újszerű módszert alkalmazunk, amellyel felgyorsíthatjuk az E. coli evolúcióját, és kísérletekkel ellenőrizhetjük a genomegyszerűsödést magyarázó hipotéziseket. Kombinálva a klónkönyvtár-készítést és rekombinációs módszereket, párhuzamos kultúrákban nagyszámú, véletlenszerű genomi deléciót generálunk. A folyamatot ciklikusan ismételve a deléciók akkumulálódnak a sejtvonalakban. A törzsek elemzése megvilágítja a genom egyszerűsödés folyamatait és a genomszerveződés törvényszerűségeit. Az egyszerűsített sejtek ugyanakkor a minimálisan szükséges genom tervrajzáról is információt szolgáltatnak.
Required language skills: angol Further requirements: molekuláris biológiai labor ismeretek