Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Bakteriális genomok mesterséges, felgyorsított evolúciója

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Szeged
biology
Doctoral School of Biology

Thesis supervisor: György Pósfai
Location of studies (in Hungarian): MTA SZBK Biokémiai Intézet
Abbreviation of location of studies: SzBK


Description of the research topic:

A genomok evolúcióját rövid, drámai expanziós ugrásokkal megszakított hosszú, dominánsan egyszerűsödéssel járó periódusok jellemzik. Ennek a folyamatnak a beható ismerete nélkülözhetetlen ahhoz, hogy mesterséges mikrobiális genomokat tudjunk tervezni. A genom evolúció tanulmányozásához a természetes ütem túl lassú, a felgyorsított laboratóriumi evolúcióhoz pedig hiányoznak a megfelelő eszközök. Egy újszerű módszert alkalmazunk, amellyel felgyorsíthatjuk az E. coli evolúcióját, és kísérletekkel ellenőrizhetjük a genomegyszerűsödést magyarázó hipotéziseket. Kombinálva a klónkönyvtár-készítést és rekombinációs módszereket, párhuzamos kultúrákban nagyszámú, véletlenszerű genomi deléciót generálunk. A folyamatot ciklikusan ismételve a deléciók akkumulálódnak a sejtvonalakban. A törzsek elemzése megvilágítja a genom egyszerűsödés folyamatait és a genomszerveződés törvényszerűségeit. Az egyszerűsített sejtek ugyanakkor a minimálisan szükséges genom tervrajzáról is információt szolgáltatnak.

Required language skills: angol
Further requirements: 
molekuláris biológiai labor ismeretek

Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2018-02-28


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )