Thesis supervisor: Zsuzsanna Györfy
Location of studies (in Hungarian): MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biokémiai Intézete Abbreviation of location of studies: SzBK
Description of the research topic:
A genomok evolúcióját rövid, drámai expanziós ugrásokkal megszakított hosszú, dominánsan egyszerűsödéssel járó periódusok jellemzik. Ezeknek a folyamatoknak az eredőjeként, hosszú evolúciós alkalmazkodás során alakult ki a mai bakteriális genomokra jellemző 0,5-10 Mbp-os méret. Az alsó mérethatárt meghatározza az élethez minimálisan szükséges génkészlet összessége. Mi limitálja az expanziót? A DNS-szintézis megnövekedett energetikai és időbeli költsége? A genom topológiai korlátai? A makromolekulák koncentrációjának és hozzáférhetőségének valamiféle optimális meghatározottsága? A kérdés vizsgálatához gyorsított, laboratóriumi genomevolúciót kívánunk megvalósítani. Újszerű, a laboratóriumunkban kidolgozandó technikákkal, pl. hiperaktív, önterjesztő transzpozonok segítségével semleges DNS-szakaszokkal „szórjuk meg” a genomot. Megvizsgáljuk, milyen hatással van a sejt fitneszére, növekedési és fizikai paramétereire a genom méretének növelése, illetve meddig lehet eljutni a genom expandálásával. Az is vizsgálat tárgya, hogy vannak-e a genomszerveződésből fakadó korlátai az expanziónak, azaz kimutathatók-e preferált, ill. tiltott helyek a genomban.
Required language skills: angol Further requirements: molekuláris biológiai labor ismeretek
Number of students who can be accepted: 1
Deadline for application: 2016-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
