Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
A komplex soksejtűség evolúciójának vizsgálata gombákban transzkriptomikai és bioinformatikai módszerekkel

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Szeged
biology
Doctoral School of Biology

Thesis supervisor: László Nagy
Location of studies (in Hungarian): MTA SZBK, Biokémiai Intézet
Abbreviation of location of studies: SzBK


Description of the research topic:

A soksejtűség megjelenése az evolúció egyik nagy lépése volt. Bár a soksejtűség evolúciója régóta a biológia egyik nagy kérdése, annak genetikai hátteréről mindezidáig csak részleges ismereteink vannak. Gombák esetében a soksejtűség amellett, hogy a szárazföld benépesítésének fő elindítója volt, nagy gazdasági és egészségügyi jelentőséggel is bír (kórokozó gombák egyik fő patogenitási faktora a hifás növekedés). A téma célja a soksejtű gombák evolúcióját lehetővé tévő genetikai folyamatok feltárása és a soksejtűség evolúciójának hátterében álló általános szabályszerűségek megértése. Gombák esetében a komplex soksejtűség két lépésben alakult ki: egysejtű fajokból először fonalas, majd ezekből 3-dimenziós termőtestekkel rendelkező komplex soksejtű gombák alakultak ki. A projekt során e két evolúciós lépést lehetővé tevő genetikai elemeket (génduplikációk, génregulációs hálózatok, splicing variansok, stb.) keressük bioinformatikai és transzkriptomikai módszerekkel. Az használt és elsajatítható módszerek között mind számítógépes komparatív genomikai (high-throughput komparatív analízisek, géncsalád elemzések, filogenetika és filogenomika) mind labortechnikák (mikro- és molekuláris biológia, transzkriptomika, egysejt-transzkriptomika, lézer-mikrodisszekció, stb.) szerephez jutnak.

Required language skills: angol
Number of students who can be accepted: 2

Deadline for application: 2016-09-30


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )