Thesis supervisor: Mónika Fuxreiter
Location of studies (in Hungarian): Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar Abbreviation of location of studies: DEÁOK
Description of the research topic:
A fehérjék evolúcióját vizsgáló szekvenciaillesztő módszerek magas aminosavsorrendbeli hasonlósági arányt, míg a szerkezetekre épülő módszerek jól meghatározható harmadlagos struktúrát követelnek meg. A lazán pakolt régiók is gyakran funkcionálisan fontosak, azonban illesztésük mindkét módszerrel problematikus. A fehérjék szekvenciális kompozíciója összefügg a rendezettségükkel, dinamikai mintázataik (Patterns Of Dynamics; POD-k) pedig az elsődleges szekvenciából jósolhatóak. A POD-k a szerkezet alacsony felbontású leírását teszik lehetővé a lokális dinamika változásain keresztül. Elemzésük alkalmas lehet a rendezetlen régiók rokonsági kapcsolatainak elemzésére, valamint kombinálható többszörös szekvenciaillesztéssel is. Terveim között szerepel egy illesztő algoritmus kidolgozása, mely alacsony szekvenciális hasonlóságú rokon fehérjék esetén is hatékonyan kimutathatja a funkcionális kapcsolatot. Célom tehát az alacsony felbontású dinamikai mintázatok széles körű elemzése és alkalmazása szerkezeti, funkcionális és evolúciós kapcsolatok vizsgálatára.
Login
