Thesis supervisor: Péter Szalay
Location of studies (in Hungarian): TTK Kémiai Intézet Abbreviation of location of studies: Kém.
Description of the research topic:
A DNS szerkezetének és szekvenciájának felderítése után annak elektronikus tulajdonságai kerültek a tudományos érdeklődés középpontjába. Mi történik a DNS-sel, ha UV sugárzás éri? Vezeti-e a DNS lánc az elektromosságot?
Kutatásainkban ezen kérdések megválaszolásához szeretnénk hozzájárulni a DNS építőelemeinek kvantumkémiai vizsgálatával.
Konkrét terveink között szerepel a nukleobázisok, ezek hidratált komplexei, nukleozidok, valamint ezek komplexei, mint a DNS alkotóelemei szerkezetének és stabilitásának vizsgálata, elektrongerjesztési spektrumok szimulálása, s ezen keresztül a DNS UV fénnyel szembeni stabilitásának pontosabb megértése. Kiterjesztenénk a számításokat elektrontranszportfolyamatokra is, amivel a DNS láncok vezetőképessége lesz tanulmányozható. Mivel a biokémia szempontjából ma érdekes nukleobázisok és ezek komplexeinek nagypontosságú számítása itthon egyáltalán nem, de vezető szuper-computer centrumokban is csak nehezen kivitelezhető, ezért átgondolt módszerfejlesztést is meg kell valósítani. Egyrészt közelítő módszerek kidolgozását tervezzük, amelyek kellően pontosak a feltett kérdések megválaszolására, másrészt olyan „kiterjesztések” számbavételét célozzuk meg, ahol a pontosság számottevően nem romlik, ám a biológia környezet figyelembe vehető: pl. explicit vízmodellek, QM/MM kapcsolás, stb.
Required language skills: angol Further requirements: Olyan hallgató(k) jelentkezését várom, aki érdeklődik a kvantumkémiai módszerek használata iránt, alapszintű számítógép-használati ismeretekkel rendelkezik és szereti a kémiát!