Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Környezeti bakteriofág-minták bioinformatikai analízisének optimalizációja

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Debreceni Egyetem
egészségtudományok
Táplálkozás- és Élelmiszertudományi Doktori Iskola

témavezető: Laczkó Levente
helyszín (magyar oldal): Debreceni Egyetem Egészségtudományi Kar
helyszín rövidítés: DEETK


A kutatási téma leírása:

Az egyre nagyobb területen jelenlévő antibiotikum-rezisztencia egyre több antibiotikum hatástalanságát okozza, ami megnehezítheti a különböző bakteriális eredetű megbetegedések kezelését. Ez a probléma szükségessé teheti alternatív terápiák alkalmazását, amelyek közül kiemelendő a bakteriofágok potenciális alkalmazása. A fágterápia várhatóan egyre nagyobb jelentőségre fog szert tenni és segítségével csökkenthető a hagyományos antibiotikumok használatának gyakorisága. Az alkalmazásuk egyik előfeltétele az, hogy az alkalmazni kívánt bakteriofágot nagy részletességgel ismerjük. A harmadik generációs szekvenálás lehetővé teszi nagy számú környezeti minta hatékony szekvenálását és ezzel a fágok felfedezését, karakterizációját. Ennek ellenére, jelenleg kevés bioinformatikai eszköz áll rendelkezésre a fágok részletes karakterizációjához és egy részük csak kisebb csoportokra fókuszál. A hallgató feladata a jelenleg rendelkezésre álló eszközök hasznosíthatóságának és korlátainak felmérése a szekvenálási technológia fejlődésének tükrében, valamint olyan ezek alapján javasolható bioinformatikai fejlesztések végzése, amik sokoldalú adatelemzés segítségével nyújtanak betekintést a bakteriofágok világába. A célkitűzés ezentúl magába foglalja a képzés ideje alatt feltárt bakteriofág genomok kereshető adatbázisba foglalását is.

előírt nyelvtudás: angol
felvehető hallgatók száma: 1

Jelentkezési határidő: 2024-05-15

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )