témavezető: Laczkó Levente
helyszín (magyar oldal): Debreceni Egyetem Egészségtudományi Kar helyszín rövidítés: DEETK
A kutatási téma leírása:
Az egyre nagyobb területen jelenlévő antibiotikum-rezisztencia egyre több antibiotikum hatástalanságát okozza, ami megnehezítheti a különböző bakteriális eredetű megbetegedések kezelését. Ez a probléma szükségessé teheti alternatív terápiák alkalmazását, amelyek közül kiemelendő a bakteriofágok potenciális alkalmazása. A fágterápia várhatóan egyre nagyobb jelentőségre fog szert tenni és segítségével csökkenthető a hagyományos antibiotikumok használatának gyakorisága. Az alkalmazásuk egyik előfeltétele az, hogy az alkalmazni kívánt bakteriofágot nagy részletességgel ismerjük. A harmadik generációs szekvenálás lehetővé teszi nagy számú környezeti minta hatékony szekvenálását és ezzel a fágok felfedezését, karakterizációját. Ennek ellenére, jelenleg kevés bioinformatikai eszköz áll rendelkezésre a fágok részletes karakterizációjához és egy részük csak kisebb csoportokra fókuszál. A hallgató feladata a jelenleg rendelkezésre álló eszközök hasznosíthatóságának és korlátainak felmérése a szekvenálási technológia fejlődésének tükrében, valamint olyan ezek alapján javasolható bioinformatikai fejlesztések végzése, amik sokoldalú adatelemzés segítségével nyújtanak betekintést a bakteriofágok világába. A célkitűzés ezentúl magába foglalja a képzés ideje alatt feltárt bakteriofág genomok kereshető adatbázisba foglalását is.
előírt nyelvtudás: angol felvehető hallgatók száma: 1