témavezető: Soós Vilmos
helyszín (magyar oldal): HUN-REN Agrártudományi Kutatóközpont, Biológiai Erőforrások Osztálya, Martonvásár helyszín rövidítés: H-REN
A kutatási téma leírása:
A D27-like karotenoid izomerázok az első olyan leírt enzimek, amelyek közvetlenül járulnak hozzá egyszerre két növényi hormon bioszintéziséhez. A D27 és a D27-LIKE1 a transz-β-karotin - 9-cisz-izomer konverziót, valamint a transz-violaxantin - 9-cisz-violaxantin átalakítást katalizálják, amelyek közvetlen prekurzorai az SL és ABA bioszintézisének. In planta, a D27 szerepe elsősorban az SL szintézis beállítására korlátozódik, míg a D27-LIKE1 befolyásolja az ABA bioszintézisét a 9-cisz-violaxantin szintjének finomhangolásával. Mindamellett, mindkét enzimnek van segédfunkciója is az ABA vagy az SL bioszintézisében. A D27-like fehérjék leszármazása azt prediktálja, hogy funkcióik inkább eltérőek, semmint redundánsak. A specificitás pontos élettani alapjai nem ismertek, de valószínű, hogy a D27-like gének expressziójának szabályozása, vagy pedig direkt enzimatikus aktivitás állhat mögötte. A funkcionális divergencia és a reguláció módjának tisztázása érdekében egy- és többszörös mutánsokat, komplementáló vonalakat, valamint ezek kombinációit ABA bioszintézisében érintett mutánsokkal vizsgáljuk Arabidopsisban és árpában két újonnan induló projekt keretében. Ismert, hogy kétszikűekben az SL-ok és az ABA egymás bioszintézisét pozitívan szabályozzák a D27-en keresztül, azonban ez nem igaz az egyszikűekre, ahol a D27-like fehérjék további, rend-specifikus funkcionális eltérést mutatnak, amelyek eddig nem ismert specifikusságot feltételeznek. Ennek tisztázása érdekében kísérleteket végzünk árpa rekombináns fehérjékkel, heterológ expressziós rendszerekkel és vad típusú valamint csendesített/KO vonalakkal, hogy képet kapjunk a D27-like fehérjék SL/ABA bioszintézisben betöltött eltérő szerepéről mezőgazdaságilag fontos egyszikű növényekben is. Ezen túlmenően karakterizáljuk a D27-like fehérjék feltételezett Fe-S klaszterét, interakcióját különféle Fe-S trafficking proteinekkel, redox érzékenységét valamint a struktúra és a funkció összefüggéseit. A PhD hallgató feladata, hogy részt vegyen a projekt menedzselésében és önállóan elvégezze a vázolt genetikai, molekuláris biológiai és enzimológiai/biokémiai vizsgálatokat.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: MSc biológus, biokémikus vagy biomérnök oklevél
Tapasztalat rekombináns fehérje rendszerekkel, vektor konstrukciók készítésében; a fehérjetudomány alapos ismerete,
Előny, ha a jelentkező ismeri az Arabidopsis genetika alapjait