témavezető: Paragi Gábor
helyszín (magyar oldal): SZTE OVI helyszín rövidítés: OVI
A kutatási téma leírása:
Elsősorban biológiailag érdekes molekulák fizikai, kémiai tulajdonságát, illetve más molekulákkal való kölcsönhatását vizsgáljuk elméleti kémiai módszerekkel. Ez részben a molekulákat lényegében klasszikusan kezelő molekulamechanikai, molekuladinamikai konformáció-analízist és a hasonló elvi alapokon nyugvó dokkolási eljárás alkalmazását jelenti konkrét rendszerekre. Másrészt, elsősorban a molekulák közötti kölcsönhatások esetében a pontosabb leírást kvantummechanikai módszerek (pl. sűrűségfunkcionál elmélet) felhasználásával adjuk meg.
1. Neurodegeneratív betegségek (pl Alzheimer-kór) számítógépes modellezése.
i. Oligomerek, peptidmimetikumok kölcsönhatásának vizsgálata amilod-β peptiddel.
ii. Aggregációs és gombolyodási folyamatok vizsgálata amiloid-β, illetve homo-polipeptidek esetében.
2. Peptidnukleinsavak konformációs vizsgálata.
3. Természetes és mesterséges nukleobázisok kölcsönhatásának vizsgálata sűrűségfunkcionál elmélettel. A szimmetria-adaptált molekulapálya módszer alkalmazása a hidrogén-híd leírására.