témavezető: Guttman András
társ-témavezető: Járvás Gábor
helyszín (magyar oldal): Pannon Egyetem, Mérnöki Kar, Bio-nanotechnológiai és Műszaki Kémiai Kutatóintézet helyszín rövidítés: PE MK
A kutatási téma leírása:
Az utóbbi évtizedekben egyre nagyobb figyelem irányult a fehérjékhez kötött N-glikánok gyógyszeripari jelentőségére és biológiai folyamatokban betöltött fontos szerepére. A fehérjéhez kötött glikánok egymáshoz viszonyított mennyiségi aránya fontos információt hordozhat bizonyos betegségek diagnosztikája szempontjából, illetve nagymolekulás, fehérje alapú gyógyszerek gyártása során fontos minőségmeghatározó tényező. Az egyik elterjedt analitikai módszer a szénhidrát oligomerek vizsgálatára a kapilláris elektroforézis, amelyhez a glikánokat egy töltéssel rendelkező fluoreszcens festékkel jelölik meg. A jelenleg széleskörűen használt kapilláris gélelektroforézis alapú glikán vizsgálati módszerek mintaelőkészítési eljárása egy, a szabad festék eltávolítását célzó lépést tartalmaz, ami erőforrásigényes, valamint annak a veszélyét hordozza, hogy csúcsarányváltozást okoz a glikánprofilban. A Ph.D. hallgató feladata egy olyan kapilláris elektroforézis módszer kifejlesztése, amely szabad festéktől tisztítatlan mintamátrixok esetén is nagy felbontással képes a célmolekulák elválasztására. Emellett feladata a létrehozott módszerrel a szilárd fázisú extrakción alapuló tisztítási folyamat hatékonyságának vizsgálata a glikánprofil megváltozás szempontjából. Mindezeken túl, a hallgató feladata egy olyan algoritmus kifejlesztése, amellyel bizonyos hibahatáron belül lehetséges egy adatbázis alapján az ismeretlen struktúrák meghatározása.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: A hallgató esetleges korábbi kutatási témája szorosan kapcsolódjon a Transzlációs Glikomika Kutatócsoport munkájához, ahol sokrétű kutatómunka folyik a bioanalitikai módszerek és eszközök témakörében.