témavezető: Solymosi Norbert
helyszín (magyar oldal): univet.hu helyszín rövidítés: ATE
A kutatási téma leírása:
Az antimikrobiális rezisztencia (AMR) korunk egyik legjelentősebb ember-, és állatgyógyászati kihívása. Az AMR genetikai alapját gének (antimikrobiális rezisztenciagének, ARG), illetve genetikai polimorfizmusok adják. Az antibiotikumok nem megfelelő alkalmazása következtében olyan baktériumtörzsek szelektálódnak, amelyek rendelkeznek AMR-t lehetővé tevő genetikai elemekkel. Horizontális géntranszfer útján ezek a genetikai determinánsok a baktériumok között átadódhatnak. Az emberi szervezetben megjelenő ARG-k egy része származhat állatokból, amelyekben azok jelenlétéért, felszaporodásáért nem kis részben az állatorvosi/állattartói tevékenység tehető felelőssé. Ha mélyebb ismereteink lennének arra vonatkozóan, hogy az állatokból, állati termékekből milyen ARG-k kerülhetnek az emberi szervezetbe, akkor javaslatokat lehetne arra vonatkozóan megfogalmazni, hogy hogyan lehetne ezt a terjedést korlátozni, visszaszorítani.
A PhD-munka során az állatról emberre történő ARG-terjedés lehetséges útvonalaiban szerepet játszó, mintázható közegeket azonosítunk. Ezekben az ARG-k jelenlétét részben szabadon elérhető (NCBI SRA, EBI ENA), részben magunk által létrehozott adatállományokban vizsgáljuk.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Állatorvos-doktori végzettség; legalább B2 angol nyelvvizsga és számítógépes ismeret. Adatbányászati, programozási, bioinformatikai és matematikai statisztikai munka iránti érdeklődés.