Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Csaba Hegedűs
Identification of compounds interfering tumor cell migration using a high-throughput method

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Debrecen
theoretical medicine
Doctoral School of Molecular Medicine

Thesis supervisor: Csaba Hegedűs
Location of studies (in Hungarian): Department of Medical Chemistry, Faculty of Medicine, University of Debrecen
Abbreviation of location of studies: DEOVI


Description of the research topic:

A tumorok metasztázis-képző tulajdonsága az egyik legnagyobb kihívás a kezelőorvosok számára. Az áttétek gyakran létfontosságú szerveken jelennek meg, melyek rövid időn belül a betegek halálát okozhatják. A Debreceni Egyetem HTS laborjaként, több sikeres szűrési projektet követően, most azt a feladatot tűzzük ki célul, hogy egy megközelítőleg 800 db gyógyszerhatóanyagot tartalmazó FDA által jóváhagyott molekulakönyvtárat alkalmazva olyan vegyületeket azonosítunk, amelyek gátolják az U2OS osteosarcoma sejtek invázióját. A scratch assay-t régóta használják a sejtek migrációs képességének mérésére. A módszer nagyszámú mintával történő alkalmazását azonban korlátozza a kézi karcolások inhomogenitása és a nagy átmérőjű edényzet használatának szükségessége. A pontos mérés is kihívást jelenthet, mivel manuális mikroszkópiával szinte lehetetlen pontosan azonos területről felvételeket készíteni különböző időpontokban. Ezért egy automatizált, kis térfogatú módszer kidolgozását tűztük ki célul, amely pontosabb, homogénebb sebzést, automatizált képalkotást és többparaméteres elemzést tesz lehetővé. A képalkotást és az elemzést a Perkin Elmer Opera Phenix High-Content Analyzer és a Harmony segítségével tervezzük beállítani. Mivel a nyitott terület csökkent benövésének több oka is lehet, a hatékony szerek újratesztelése során vizsgálatainkat Hoechst-Sytox zöld kettős festéssel egészítjük ki. Ezzel a kombinációs megközelítéssel különbséget lehet tenni a sejtmigrációt, proliferációt és életképességet befolyásoló vegyületek között. Ezt követően meghatározzuk a hatékonynak bizonyult szerek pontos hatásmechanizmusát, feltárjuk a migrációgátlás hátterében álló jelátviteli folyamatokat. A leghatékonyabb vegyület(ek) hatását más sejtvonalakon, illetve egérmodellen is szeretnénk vizsgálni.

Required language skills: English intermediate level
Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2024-11-15

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )