Thesis supervisor: Dóra Karancsiné Menyhárd
Location of studies (in Hungarian): ELTE TTK Kémia Intézet Szerves Kémia Tanszék Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium Abbreviation of location of studies: ELTE
Description of the research topic:
A fehérjék katalitikusan aktív szerkezetének részleges vagy teljes letekeredése - sérülések, mutációk, környezeti változások vagy kölcsönhatási partnerek megjelenése vagy éppen távolléte által kiváltatott szerkezeti destabilizációja - gyakran vezet aggregációhoz. A hosszútávú rendezettséggel rendelkező aggregátumokat amiloidoknak hívjuk. Az amiloid aggregáció gyakran betegségokozó folyamata a fehérjék aktív formájának elvesztésén túl, pusztán a lerakodások megjelenése által is megzavarhatja a fiziológiás rendet, de vannak példák arra is, hogy a szervezet kihasználja peptidek tárolására és gyors felszabadítására a reverzibilissé tett aggregációt. Ezen finoman szabályozott folyamatok vizsgálatába lehetne bekapcsolódni. Csoportunkban kísérleti módszerekkel (spektroszkópiás NMR, és krisztallográfiai módszerekkel) is vizsgáljuk ezeket a folyamatokat, de a jelen témában a hangsúly a számításos megközelítésen lenne. Molekulamodellezési módszerekkel építünk modelleket és végzünk szimulációkat, amelyek az aggregálódott szerkezetek meghatározó kölcsönhatásainak és magának az aggregációs folyamatnak atomi szintű értelmezését teszik lehetővé. Jelenleg két fehérje kapcsán folynak vizsgálatok: 1. TTR, homotetramer neuroprotektív fehérje, mely mutációk és az öregedés folyamatai kapcsán amiloid lerakódások formájában kicsapódhat és lerakódásai különböző súlyos szívbetegségek kialakulásához vezetnek, valamint 2. különböző gasztrointesztinális peptid-hormonok, melyeket a szervezetünk alacsony pH-n amiloid struktúrákba rendezve tárol vezikulákban és onnan tudja pillanatszerűen, nagy mennyiségben felszabadítani őket és indukálni gyors feltekeredésüket, a cukorháztartás folyamatainak szabályzásához.
Required language skills: English Number of students who can be accepted: 2