 Az INI1 szupresszor gén vizsgálata epithelioid sarcomákban. THESIS TOPIC PROPOSAL Institute: Semmelweis University, Budapest theoretical medicine Doctoral School of University Semmelweis Thesis supervisor: Zoltán Sápi Location of studies (in Hungarian): SE-I.sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet Abbreviation of location of studies: SE Description of the research topic: A rhabdoid tumorok és epithelioidsarcomákpathogenézisében az INI1 gén által kódolt fehérje hiánya egyaránt fontos szerepet játszik. A rhabdoid tumorok esetén jól ismert, hogy az immunreakcióval kimutatható magfehérje hiánya az INI1 gén biallelikus mutációjával és/vagy deléciójával függ össze, míg epithelioidsarcomák esetén többségben nincs ilyen genetikai eltérés. A kérdés az, hogy epithelioidsarcomáknál milyen epigenetikai mechanizmusok lehetnek felelősek a magfehérje hiánya tekintetében. Munkaterv: Az összegyűjtött epithelioidsarcomákimmunhisztikémiai vizsgálata az INI1 magprotein meglétét vagy hiányát illetően (30 archív eset). Az INI1 negatív esetek további vizsgálata FISH-el, BCR/ABL dualcolortranslocation próbát használva, minthogy a BCR régió deléciója egyben az INI1 régió delécióját is jelzi. Mintegy 70%-ban várjuk, hogy csak egy allél veszteség legyen. A biallelikusdeléciót mutató esetek kivételével az INI1 gén mutáció analízise PCR-el, majd sequenálással mind a 9 exon tekintetében. Ezzel meg tudjuk becsülni, hogy hány esetben van mindkét allélon eltérés, és hány esetben nem magyarázható az INI1 negatívitás genetikai eltéréssel. A biallelikus eltérés várható aránya 10%, ennek megfelelően a továbbvizsgálandóé 90%. A szekvencia analízis eredményeinek kiértékelése. DNS primerek tervezése az INI1 gén promóter régiója tekintetében. Epigentikusszekvenálás( ahypermetilált területek meghatározása a promóter régióban), minden olyan esetben, amikor nincs biallelikus károsodás. Number of students who can be accepted: 3 Deadline for application: 2024-11-01 |