Thesis supervisor: Éva Várallyay
co-supervisor: Zsuzsanna Nagyné Dr. Galbács
Location of studies (in Hungarian): MATE-Növényvédelmi Intézet Abbreviation of location of studies: MATE
Description of the research topic:
A kultúrnövények hatékony termesztését számos biotikus tényező veszélyezteti. A gyomok, a kultúrnövényekkel történő társulásban jelentős mértékben képesek a kultúrnövények növekedését és fejlődését elnyomni, míg a vírusok képesek megzavarni a növények élettani folyamatait, ezáltal változatos tüneteket okozva a gazdanövényen. Mindkét tényező a terméshozam súlyos csökkenéséhez vezethet, kártételük ellen különböző növényvédelmi módszerekkel szükséges védekezni.
Különféle vírusok széles körben elterjedtek a gyomnövényekben. Ezek a vírusok megfertőzhetik a kultúrnövényeket, másrészt a kultúrnövényekben jelenlévő vírusok megfertőzhetik a vadon élő növénypopulációkat. Ez a folyamat, a rezervoárokból egy új környezetbe történő vírusátvitel, sikeres fertőzésekkel és a gazdaszervezet kolonizációjával, egy döntő lépés az új vírusok megjelenése szempontjából.
A növényi vírusokat a legtöbb esetben rovarvektorok terjesztik, ami növelheti a vírusok keresztirányú átvitelének valószínűségét. A növényi vírusokat többnyire haszonnövényekben azonosították. A gyomnövényekben jelenlévő vírusok sokféleségéről, előfordulásáról és dinamikájáról kevés információ áll rendelkezésre, ezért egyre inkább szükségessé válik az epidemiológiájának megismerése.
Hagyományos diagnosztikai módszerekkel csak egy adott kórokozó jelenlétét tudjuk vizsgálni, de az új metagenomikai megközelítésekkel a vizsgált mintában jelenlevő összes kórokozó jelenlétét igazolni tudjuk.
A projekt célja szőlő ültetvényekben és gyümölcsösökben előforduló selyemkóró növények (és a rajta előforduló és táplálkozó rovarvektorok?) patogénnel való fertőzöttségének felmérése nagy áteresztőképességű szekvenálások segítségével. A pályázó a mintagyűjtéstől az nagy áteresztőképességű szekvenáláson és bioinformatikai elemzésén keresztül az eredmények különböző molekuláris biológiai alapú módszerekkel történő validálásáig részt venne a munkában. A várható eredmények a növényvédelmi gyakorlat számára is közvetlenül hasznosíthatóak.
Login
