Thesis supervisor: András Kis
Location of studies (in Hungarian): MATE GBI Abbreviation of location of studies: GBI
Description of the research topic:
A genomszerkesztés egy hatékony molekuláris biológiai technológia, amely helyspecifikus mutációkat indukál a növények, állatok vagy mikrobák genomjában. A genomszerkesztés sikeres rutinszerű laboratóriumi alkalmazása lehetővé teszi a célgének pontos vizsgálatát, ami hatékony eszköz a komplex biológiai folyamatok megértéséhez, nemcsak a modellnövényekben, hanem gazdaságilag fontos növényfajokban is. Laboratóriumunkban rutinszerűen végezzük az árpa genomszerkesztést és ezeket a kísérleteket szeretnénk kiterjeszteni más fontos gabonafajokra, például különböző búzafajtákra is. Összehasonlító bioinformatikai megközelítésekkel olyan árpagéneket fogunk azonosítani gazdaságilag jelentős gabonafajták termelési mutatóinak növelése érdekében, amelyek részt vesznek az RNS-interferencia (RNSi) általi szabályozásban és/vagy gazdaságilag fontos tulajdonságok meghatározásában, mint például a magok száma és/vagy mérete. Szintén vizsgálni kívánjuk az RNSi-hez kapcsolódó kis szabályozó RNS-ek szerepét a növényi fejlődése során, amelyek befolyásolhatják a haszonnövények hasznos tulajdonságait. Az azonosított géneket genomszerkesztéssel mutáljuk, és a mutáns növényeket különböző körülmények között vizsgáljuk a jelölt gének szerepének feltárása érdekében. A tervezett kísérleteket a MATE Genetikai és Biotechnológiai Intézetében zajlanak, amely rendelkezik a tervezett kísérletek nemzetközi színvonalú elvégzéséhez szükséges infrastruktúrával. A sikeres pályázó standard molekuláris biológiai módszereket (RNS és DNS kivonás, molekuláris klónozás, PCR, Q-PCR, Northern és Western blot technikák, növényi fenotipizálás stb.) és alapvető informatikai elemzéseket (Blast, nagy áteresztőképességű szekvenálási adatok elemzése) fog végezni munkája során.