Témakiírások
Az Aspergillus nidulans fonalas gomba AtfA transzkripciós faktorának vizsgálata
témakiírás címe
Az Aspergillus nidulans fonalas gomba AtfA transzkripciós faktorának vizsgálata
intézmény
doktori iskola
témakiíró
tudományág
témakiírás leírása
Az AtfA transzkripciós faktor az ATF/CREB protein család tagja, funkcióit nem ismerjük.
Tervezett kísérletek:
1. A gén szekvenciájának megszakítása double-joint PCR-rel.
2. A atfA A. nidulans törzs fenotípusának vizsgálata.
3. A transzkripciós faktor expressziójának vizsgálata stresszhatásokra (Northern blott,qPCR)
4. A protein lokalizációjának, és a stresszhatásokra bekövetkező változásainak detektálása, GFP taggel ellátott atfA szekvencia genomba történő homológ integrációjával.
5. Anti-GFP antitest alkalmazásával a fúziós protein Western blotton kimutatható. A protein foszforilációja esetén a jelenség detektálható.
6. Az A. nidulans AtfA heterodimerizációs partnerének azonosítása élesztő két-hibrid rendszer alkalmazásával.
7. Az AtfA lokalizációjának ill. foszforiláltsági státuszának vizsgálata az őt közvetlenül foszforiláló kinázra mutáns törzsben, vagyis kinázának azonosítása/igazolása.
Tervezett kísérletek:
1. A gén szekvenciájának megszakítása double-joint PCR-rel.
2. A atfA A. nidulans törzs fenotípusának vizsgálata.
3. A transzkripciós faktor expressziójának vizsgálata stresszhatásokra (Northern blott,qPCR)
4. A protein lokalizációjának, és a stresszhatásokra bekövetkező változásainak detektálása, GFP taggel ellátott atfA szekvencia genomba történő homológ integrációjával.
5. Anti-GFP antitest alkalmazásával a fúziós protein Western blotton kimutatható. A protein foszforilációja esetén a jelenség detektálható.
6. Az A. nidulans AtfA heterodimerizációs partnerének azonosítása élesztő két-hibrid rendszer alkalmazásával.
7. Az AtfA lokalizációjának ill. foszforiláltsági státuszának vizsgálata az őt közvetlenül foszforiláló kinázra mutáns törzsben, vagyis kinázának azonosítása/igazolása.
felvehető hallgatók száma
1 fő
jelentkezési határidő
2008-01-31